水石和玉石的成分不同，水石的主要成分是二氧化硅，玉石的主要成分是硅酸盐铝钠和钙镁硅酸盐。结构不同，水石结构为李庄结合结构，玉石结构为纤维交织状。硬度不同，水石硬度较高，脆性强，容易断裂，玉石硬度较小，不易碎裂。

1、成分不同

成分不同是水石和玉石主要的区别之一，水石的主要成分是二氧化硅，而玉石分为硬玉和软玉，其中最具代表的的硬玉是翡翠，主要成分是硅酸盐铝钠。最具代表性的软玉是和田玉，主要成分是钙镁硅酸盐。

2、结构不同

此外水石和玉石的结构也有所区别，玉石中的和田玉、翡翠内部结构为纤维交织状，透光可以看到内部存在一些棉絮，而水石的内部晶体为李庄结合结构。

3、硬度不同

水石和玉石的硬度同样存在区别，水石的硬度较高，但是脆性强，容易断裂。而玉石的硬度较小，脆性和水石相比较弱，不易碎裂。